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植物源除草劑的品種較少，僅有脂肪類非選擇性除草劑壬酸得到了開發。 該除草劑源自牻牛兒苗科植物，通過抑制植物細胞呼吸作用、破壞細胞膜形成而防除一年生和多年生闊葉雜草，低濃度下還具有疏花疏果作用。 此外，脂肪酸、芝麻油（粕）等在美國還被用作殺線蟲劑。 植物源的植物生長調節劑一般優先歸入生物化學類農藥進行管理。

微生物農藥

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微生物農藥是將工業化大量繁殖的有害生物的病原微生物活體加以利用的農藥，主要有單細胞的細菌和原生動物，涵蓋黴菌和卵菌的真菌，以及無細胞結構的病毒等，包括各微生物活體原型及其基因修飾體。 由於通過共生菌繁殖對靶標害蟲起作用，昆蟲病原線蟲也多被歸為微生物農藥。 微生物農藥一般具有較高的特異性，只對靶標生物具有致病性，對人畜低毒，也不能滲透到植物體內。 此外，微生物農藥的作用方式複雜，對多種發育階段的靶標生物均有效，有害生物難以對其產生抗性。 中國微生物源農藥品種及其生物學分類見表4。作為殺蟲劑，細菌活體農藥主要通過其營養體芽孢在害蟲體內繁殖和/或代謝分泌活性蛋白酶和抗生素等方式來防治或殺死植物寄生線蟲和害鼠等靶標生物;真菌活體農藥則是以分生孢子附著於靶標害蟲的表皮，在一定的條件下萌髮長出芽管或形成附著孢，進入害蟲體內后形成的菌絲體不斷繁殖而造成物理損害並引起病理變化，最後導致害蟲死亡 ;病毒活體農藥在寄生后通過核酸複製產生大量的病毒粒子，使寄主細胞破裂而死亡;原生動物蝗蟲微孢子蟲在被蝗蟲或蟋蟀取食後寄生於其脂肪細胞而消耗其能量儲備，使其虛弱死亡。

作為殺菌劑，細菌活體農藥的作用機制主要涉及由其代謝分泌產生活性抗菌或調節微生境的物質、在空間和營養等方面與致病菌進行競爭，以及誘導植物抗病抗逆性等方面;真菌活體農藥主要通過重寄生、營養競爭、酶系裂解和誘導抗性等來實現對病原菌的控制。 暫無用於殺菌的病毒和原生動物，也鮮見成功開發的微生物除草劑。

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作為一類重要的害蟲生物防治因數，昆蟲病原線蟲具有昆蟲天敵和微生物活體的雙重屬性，侵染期幼蟲（即III齡幼蟲或耐受態幼蟲）進入寄生昆蟲的血腔後釋放共生菌，後者在昆蟲血淋巴中快速繁殖而使其患敗血症死亡。 昆蟲病原線蟲對土棲性及鑽蛀性害蟲多具有專一性，對人畜安全，不污染環境，在美國可免於註冊登記。

農用抗生素